《管理辦法》共八章56條，涵蓋總則、職責分工、證章管理、簽發管理、檔案管理、使用管理、監督管理和附則等內容。

(一)第一章“總則”

明確《管理辦法》的制定依據、適用范圍，闡述《出生醫學證明》的功能和作用，強調其作為法定醫學證明的重要地位。

(二)第二章“職責分工”

確定衛生健康、公安等部門以及助產機構、管理機構、簽發機構的職責，建立機構《出生醫學證明》管理和簽發人員終身責任追究制度，確保責任落實。

(三)第三章“證章管理”

明確《出生醫學證明》空白證、廢證、印章等管理要求，包括申領、發放、保管、遺失處置等環節，保障證章管理的安全性和規范性。

(四)第四章“簽發管理”

明確首次簽發、換發和補發等情形的概念、簽發流程和要求，嚴格規范《出生醫學證明》的簽發工作，確保簽發過程嚴謹、有序。

(五)第五章“檔案管理”

規定《出生醫學證明》檔案管理、信息安全和保密等要求，保障檔案資料的完整性和安全性。

(六)第六章“使用管理”

明確《出生醫學證明》辦理出生戶口登記的要求和真偽鑒定工作流程，確保其在實際使用中的合法性和有效性。

(七)第七章“監督管理”

明確對機構及其人員的監督管理要求，依法查處涉及《出生醫學證明》的違法犯罪活動。

(八)第八章“附則”

明確解釋主體和有效期，為《管理辦法》的實施提供明確指引。